Zum Hauptinhalt springenSkip to page footer

Data Scientist (m/w/d) / Bioinformatiker (m/w/d)

Stammzellbiologie
38.5 Stunden
auf 36 Monate befristet
ab 01.10.2025
Eingruppierung gemäß TV-L
Universitätsklinikum Erlangen
Abteilung Stammzellbiologie
Pooja Gupta
91054 Erlangen
Ansprechperson bei Fragen
Dr. Pooja Gupta
Group Leader 'Bioinformatics for Multiomics'
Telefon: 09131 85-42840
Data Scientist (m/w/d) / Bioinformatiker (m/w/d)
Job-Nr.: 11098
Dr. Pooja Gupta
Group Leader 'Bioinformatics for Multiomics'
Telefon: 09131 85-42840
Universitätsklinikum Erlangen
Abteilung Stammzellbiologie
Pooja Gupta
91054 Erlangen
Data Scientist (m/w/d) / Bioinformatiker (m/w/d)
Job-Nr.: 11098
Universitätsklinikum Erlangen
Abteilung Stammzellbiologie
Pooja Gupta
91054 Erlangen
Ansprechperson bei Fragen
Dr. Pooja Gupta
Group Leader 'Bioinformatics for Multiomics'
Telefon: 09131 85-42840

Kontakt aufnehmen

Mit Dienstzeiten, die zu
Deinem Leben passen!

Das Universitätsklinikum Erlangen steht für exzellente Patientenversorgung, innovative Forschung und eine hochwertige medizinische Ausbildung. Mit über 9.800 qualifizierten Mitarbeitenden zählt das Klinikum zu den größten Arbeitgebern in Mittelfranken und trägt durch kontinuierliche Weiterentwicklung maßgeblich zum medizinischen Fortschritt bei.

Im Rahmen des Transregio-Forschungsverbunds TRR 417 „Zelluläre Kommunikation im Stroma des kolorektalen Karzinoms: Von der Pathophysiologie bis zur klinischen Translation“ kooperieren die Universitätskliniken Erlangen, Frankfurt und Freiburg intensiv. Ziel des Verbunds ist es, die komplexen Interaktionen im Tumormikromilieu des kolorektalen Karzinoms eingehend zu erforschen und innovative Therapieansätze zu entwickeln.

Durch diese interdisziplinäre Spitzenforschung schaffen die beteiligten Universitätskliniken die wissenschaftliche Grundlage für verbesserte Behandlungsmöglichkeiten sowie eine nachhaltige Optimierung der Versorgung von Patientinnen und Patienten mit kolorektalem Karzinom. Gestalten Sie mit uns gemeinsam die Zukunft der Medizin und werden Sie Teil unseres engagierten Teams.

Die Aufgaben

  • Forschungsdatenmanagement (RDM) gemäß FAIR-Prinzipien zur Sicherstellung langfristiger Datenverfügbarkeit und -nachnutzbarkeit
  • Bioinformatische Analyse und Integration von Single-Cell-, Bulk-RNA-seq-, Metabolomics und weiteren Omics-Datensätzen im Rahmen des TRR417
  • Entwicklung und Anwendung statistischer Methoden zur Auswertung großskaliger biologischer Datensätze
  • Visualisierung und Interpretation komplexer molekularbiologischer Ergebnisse in enger Zusammenarbeit mit experimentellen Partnern
  • Erstellung und Veröffentlichung wissenschaftlicher Publikationen sowie Präsentation der Ergebnisse auf internen und externen Fachveranstaltungen

    • Das Know-how dafür

  • Abgeschlossenes Studium (Master oder Promotion) in Bioinformatik, Computational Biology, Data Science oder einer verwandten Fachrichtung
  • Vertraut mit den FAIR-Prinzipien und deren praktischer Umsetzung
  • Erfahrung mit biomedizinischen Daten und Metadatenstandards (z. B. MIAME, MINSEQE, OME)
  • Praxis in Datenversionierung (z. B. Git) und Workflow-Management (z. B. Snakemake, Nextflow)
  • Erfahrung in der Analyse von Hochdurchsatzdaten (z. B. RNA-seq, Single-Cell Omics)
  • Sicherer Umgang mit Python und/oder R sowie gängigen Bioinformatik-Frameworks (z. B. Scanpy, Seurat, Bioconductor)
  • Vertiefte Kenntnisse in Statistik und Machine Learning, idealerweise mit Erfahrung in Graph Neural Networks (GNNs)
  • Ausgeprägte Teamfähigkeit, selbstständige und strukturierte Arbeitsweise sowie Freude an interdisziplinärer Zusammenarbeit

    • Benefits, mit denen Du im FlexTEAM arbeitest

    Betriebliche Altersvorsorge

    Tarifliche Vergütung

    JobBike

    Ausgezeichnete Essensmöglichkeiten

    Mitarbeitendenapotheke

    Gesundheitsangebote

    Satte Rabatte

    Zulagen

    Alle Benefits im FlexTEAM

    Betriebliche Altersvorsorge

    Schon jetzt an später denken! Für Ihre betriebliche Altersvorsorge kooperieren wir mit der größten Zusatzversorgungskasse, der Versorgungsanstalt des Bundes und der Länder (kurz: VBL), und tragen damit als Arbeitgeber zusätzlich zur Rente unserer Tarifbeschäftigten bei.

    Ausgezeichnete Essensmöglichkeiten

    Unser Mitarbeitendenrestaurant heißt Palmeria. Dort bekommen Sie unser mehrfach ausgezeichnetes, kostengünstiges Mittagessen. Zusätzlich können Sie sich in unseren Kioskbetrieben versorgen oder sich für eine der zahlreichen Essensmöglichkeiten rund um unser Uniklinikum entscheiden.

    Tarifliche Vergütung

    Am Uniklinikum Erlangen wenden wir Tarifverträge an (TV-L/TV-Ä), die Ihre Bezahlung festlegen. Dies bedeutet, dass Ihr Gehalt und dessen Entwicklung von Anfang an transparent und verlässlich geregelt sind und Sie automatisch von regelmäßigen Gehaltssteigerungen profitieren.

    Mitarbeitendenapotheke

    Unsere Apotheke berät professionell und hält für unsere Beschäftigten neben lagerhaltigen Artikeln ein wechselndes saisonales Sortiment bereit, das apothekenübliche Kosmetikartikel mit einschließt. Die Artikel sind per Click & Collect über das Mitarbeitendenportal bestellbar.

    JobBike

    Viele unserer Mitarbeitenden kommen täglich mit dem Fahrrad zur Arbeit. Das wäre auch für Sie eine Option und Sie sind noch auf der Suche nach dem passenden Leasing-Fahrrad? Alle Beschäftigten des Uniklinikums Erlangen können das sogenannte JobBike Bayern beziehen und nutzen, wenn sie die tariflichen Voraussetzungen dafür erfüllen.

    Zulagen

    Am Uniklinikum Erlangen erhältst Du in der Pflege zusätzlich zu Deiner tariflich geregelten Vergütung eine sogenannte „Universitätszulage“, deren Höhe dynamisch angepasst wird. Außerdem werden weitere Pflegezulagen für bestimmte Tätigkeiten gezahlt, beispielsweise für den Einsatz im OP oder auf einer Intensivstation. 

    Gesundheitsangebote

    Unser Betriebliches Gesundheitsmanagement unterbreitet allen Mitarbeitenden – vom Präventionsprogramm über Rückenschulungen am Arbeitsplatz bis hin zur Psychosozialen Unterstützung – zahlreiche Angebote, die die Ressource Gesundheit als oberstes Gut unserer Beschäftigten in den Mittelpunkt stellen. 

    Satte Rabatte

    Gut sparen können Sie bei uns mit Corporate Benefits und zahlreichen Rabattangeboten von lokalen Partnerinnen und Partnern, die die Arbeit unserer Beschäftigten schätzen und mit Nachlässen honorieren möchten. Von Kosmetikartikeln über Dienstleistungen bis hin zu Fahrrädern und Autos sind Schnäppchen garantiert.

    Weitere Stellenangebote im FlexTEAM

    Oberarzt für Plastische und Ästhetische Chirurgie (m/w/d)

    Fachbereich Pflege:
    Zum Stellenangebot

    Studienarzt mit Möglichkeit zur Weiterbildung Facharzt für Augenheilkunde (m/w/d)

    Fachbereich Pflege:
    Zum Stellenangebot

    Arzt (m/w/d)

    Fachbereich Pflege:
    Zum Stellenangebot

    Fach- oder Oberarzt Pathologie (m/w/d)

    Fachbereich Pflege:
    Zum Stellenangebot

    PhD position in Infection Immunology (m/f/d)

    Fachbereich Pflege:
    Zum Stellenangebot

    PhD position in Bioinformatics and Super-Resolution Imaging

    Fachbereich Pflege:
    Zum Stellenangebot

    Psychologe als wissenschaftlicher Mitarbeiter in der Medizinischen Psychologie und Medizinischen Soziologie (m/w/d)

    Fachbereich Pflege:
    Zum Stellenangebot

    Oberarzt für Psychosomatische Medizin (m/w/d)

    Fachbereich Pflege:
    Zum Stellenangebot

    Assistenzarzt in oder zur Facharztweiterbildung (w/m/d)

    Fachbereich Pflege:
    Zum Stellenangebot

    Oberarzt Kinderkardiologie (m/w/d)

    Fachbereich Pflege:
    Zum Stellenangebot

    Naturwissenschaftlicher Doktorand/PhD Position in Virologie/Immunologie (m/w/d)

    Fachbereich Pflege:
    Zum Stellenangebot

    Oberarzt Neuroradiologie (m/w/d)

    Fachbereich Pflege:
    Zum Stellenangebot

    Oberarzt für Laboratoriumsmedizin (m/w/d)

    Fachbereich Pflege:
    Zum Stellenangebot

    Interesse? Melde Dich ganz unverbindlich bei mir!

    Als Recruiterin bin ich Deine erste Ansprechpartnerin. Ruf gerne an oder hinterlasse mir ganz unkompliziert eine Nachricht.

    Zum Kontaktformular

    Ich melde mich schnellst möglich bei Dir.

    Julia Pecho

    Recruiterin

    09131 85-49847

    flexteam(at)uk-erlangen.de