PhD-Doktorand im Rahmen des CRC/TRR 225 (m/w/d)
Medizinische Klinik 4
Prof. Dr. Janina Müller-Deile, MHBA
Ulmenweg 18
91054 Erlangen
Prof. Dr. Janina Müller-Deile,
MHBA
Telefon: 09131 85-42960
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Job-Nr.: 11813
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Der Sonderforschungsbereich/Transregio CRC/TRR 225 „From the Fundamentals of Biofabrication towards Functional Tissue Models“ ist ein interdisziplinärer Forschungsverbund der Universitäten Würzburg, Bayreuth und Erlangen-Nürnberg.
Der TRR225 entwickelt innovative Biofabrikationsstrategien – insbesondere automatisierte 3D-Drucktechnologien – zur Verarbeitung lebender Zellen und Biomaterialien zu komplexen Gewebemodellen. Diese fortgeschrittenen in vitro-Modelle eröffnen neue Perspektiven in der pharmazeutischen Forschung, der Krebs- und Infektionsforschung, unterstützen die Reduktion von Tierversuchen und bieten langfristige Möglichkeiten für die regenerative Medizin.
Seit seiner Einrichtung im Jahr 2018 hat der Verbund erhebliche wissenschaftliche Fortschritte erzielt, internationale Sichtbarkeit erlangt und tritt 2026 in die dritte Förderperiode ein.
Die ausgeschriebene Position ist Teil des Teilprojekts C06 – Biofabrication strategies for modelling kidney compartments and diseases, das sich auf die Entwicklung physiologisch relevanter in vitro-Modelle zentraler Nierenstrukturen mittels moderner Biofabrikationsansätze konzentriert. Dies umfasst die Weiterentwicklung eines dynamischen Modells der glomerulären Filtrationsbarriere mit aus humanen induzierten pluripotenten Stammzellen (hiPSCs) abgeleiteten Podozyten und patientenspezifischen glomerulären Zellen zur Untersuchung von Krankheitsmechanismen, zirkulierenden Faktoren und therapeutischen Reaktionen unter kontrollierten biomechanischen Bedingungen. Parallel dazu wird ein zunehmend komplexes Modell des proximalen Tubulus auf Basis von Melt-Electrowriting-Gerüsten entwickelt. Zusätzlich integriert C06 Nieren- und Gefäßorganoide in biofabrizierte Fasernetze, um eine gezielte Vaskularisierung und Reifung in Bioreaktoren zu ermöglichen. Zusammengenommen erlauben diese Modelle hochauflösende Analysen renaler Pathophysiologie, unterstützen personalisierte Medizinansätze und tragen zur Reduktion von Tierversuchen bei.
Die Aufgaben
- Mitarbeit an der Entwicklung und Optimierung biofabrizierter Modelle der glomerulären Filtrationsbarriere (GFB), einschließlich Kultivierung, Differenzierung und Charakterisierung von hiPSC-abgeleiteten Podozyten aus Patienten- und Kontrolllinien
- Unterstützung bei der Anpassung und dem Betrieb von Bioreaktorsystemen mit Fluss- und Druckkontrolle sowie Durchführung funktioneller Assays
- Beteiligung an der Herstellung von MEW-basierten PcPrOx-Gerüsten und hydrogelbasierten Tubulusmodellen; Auskleidung mit Endothel- und proximalen Tubuluszellen; strukturelle und funktionelle Validierung mittels Mikroskopie und Immunhistochemie
- Mitwirkung bei der Bioassemblierung und Vaskularisierung von Nierenorganoiden in MEW-Fasernetzen, einschließlich Bioprinting von Gefäßorganoiden und Analyse unter dynamischen Kulturbedingungen im Bioreaktor
- Datenauswertung (z. B. Bildgebung, Genexpression, Bulk-RNA-Sequenzierung in Kooperation mit Projektpartnern) sowie Mitarbeit an Dokumentation, Berichterstattung und Publikationen
- Aktive Mitwirkung in der Zusammenarbeit innerhalb des CRC/TRR-Netzwerks und Austausch mit assoziierten Teilprojekten
Das Know-how dafür
- Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master oder gleichwertig) in Zellbiologie, Biomedizin, Biotechnologie, Molekularer Medizin, Bioengineering oder einem verwandten Fachgebiet
- Nachgewiesene Erfahrung in der Zellkultur, idealerweise auch mit Primärzellen, Stammzellen oder differenzierten Zelltypen.
- Interesse an 3D-Zellkultur, Tissue Engineering oder biomaterialbasierten Ansätzen
- Bereitschaft, eng mit der biofabrikativen Partnerarbeitsgruppe zusammenzuarbeiten
- Kenntnisse in mikroskopischen Verfahren
- Sehr gute Kommunikationsfähigkeiten sowie Freude an interdisziplinärer Teamarbeit
- Gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift
Zusätzlich von Vorteil
- Erfahrung mit molekularbiologischen Methoden
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